10/06/2021

Δημιούργησαν «σούπερ βακτήριο» που αντιστέκεται στους ιούς

Ο κεντρικός κώδικας για τη βιολογία είναι απλός. Τα DNA μεταφράζεται σε αμινοξέα τα οποία είναι τα δομικά συστατικά των πρωτεϊνών. Οι πρωτεΐνες χτίζουν το σώμα μας, ρυθμίζουν το μεταβολισμό μας και μας επιτρέπουν να λειτουργούμε ως ζωντανά όντα. Ο σχεδιασμός προσαρμοσμένων πρωτεϊνών συχνά σημαίνει ότι μπορούν να επανασχεδιαστούν μικρές μορφές ζωής, όπως βακτήρια. Η ζωή στη Γη είναι ένας συνδυασμός 64 κωδικών τριπλού DNA ή «κωδικονίων», που μεταφράζεται σε 20 αμινοξέα. Τι γίνεται λοιπόν αν χρησιμοποιήσουμε τα πλεονάζοντα κωδικόνια όλων των ζωντανών όντων και αντ’ αυτού εισάγουμε τον δικό μας τεχνητό κώδικα;

Μια ομάδα στο Πανεπιστήμιο του Κέιμπριτζ πρόσφατα έκανε ακριβώς αυτό. Χρησιμοποίησαν CRISPR για να αντικαταστήσουν πάνω από 18.000 κωδικόνια με συνθετικά αμινοξέα που δεν υπάρχουν πουθενά στον φυσικό κόσμο. Το αποτέλεσμα είναι ένα βακτήριο που είναι ανθεκτικό σε όλες σχεδόν τις ιογενείς λοιμώξεις, επειδή δεν διαθέτει τις κανονικές πρωτεΐνες που οι ιοί χρησιμοποιούν για να μολύνουν ένα κύτταρο.

Μέχρι τώρα, οι επιστήμονες μπόρεσαν να εισάγουν μόνο ένα αμινοξύ σε έναν ζωντανό οργανισμό. Η νέα δυνατότητα ανοίγει την πόρτα στο να «χακάρουν» πολλά υπάρχοντα κωδικόνια ταυτόχρονα, αντιγράφοντας τουλάχιστον τρία συνθετικά αμινοξέα ταυτόχρονα. Και όταν είναι 3 στα 20, αυτό αρκεί για να ξαναπρογραμματίσουμε τη ζωή που υπάρχει στη Γη. Ένα ερώτημα είναι αν “θα μπορούσαμε να μειώσουμε τον αριθμό των κωδικονίων που χρησιμοποιούνται για την κωδικοποίηση ενός συγκεκριμένου αμινοξέος και επομένως να δημιουργήσουμε κωδικόνια που είναι ελεύθερα να δημιουργούν άλλα μονομερή [αμινοξέα];” δήλωσε ο κύριος συγγραφέας Δρ Jason Chin. Είναι μια σπουδαία ιδέα στη θεωρία, αλλά στην πράξη ένα πραγματικά πολύ δύσκολο έργο. Αυτό σημαίνει ότι η ομάδα πρέπει να εισέλθει σε ένα κύτταρο και να αντικαταστήσει κάθε κωδικόνιο που θέλει να επαναπρογραμματίσει.

Λίγα χρόνια πριν, η ίδια ομάδα έδειξε ότι είναι δυνατό στο βακτήριο E. Coli. Εκείνη την εποχή, η ομάδα έκανε ένα αστρονομικό άλμα στη συνθετική βιολογία, συνθέτοντας ολόκληρο το γονιδίωμα του E. Coli από το μηδέν. Είναι σαν να παίρνεις ένα πολύ μεγάλο βιβλίο και να καταλαβαίνεις ποιες λέξεις θα αντικαταστήσεις με συνώνυμα χωρίς να αλλάζεις το νόημα των προτάσεων, έτσι ώστε οι αλλαγές να μην βλάψουν φυσικά την επιβίωση των βακτηρίων. Προηγούμενη εργασία έδειξε ότι αυτό μπορεί να προσθέσει νέα δομικά στοιχεία σε φυσικά κωδικόνια που είναι πραγματικά «κενά», δηλαδή δεν κωδικοποιούν τίποτα φυσικά.

Η ομάδα δημιούργησε μια μέθοδο που ονομάζεται REXER, η οποία περιλαμβάνει το εργαλείο επεξεργασίας γονιδίων wunderkind, CRISPR-Cas9. Με το CRISPR, έκοψαν με ακρίβεια μεγάλα μέρη του βακτηριακού γονιδιώματος του E.coli, φτιαγμένα εξ ολοκλήρου από το μηδέν μέσα σε ένα δοκιμαστικό σωλήνα και στη συνέχεια αντικατέστησαν περισσότερα από 18.000 «επιπλέον» κωδικόνια που κωδικοποιούν τη σερίνη, με συνώνυμα κωδικόνια. Επειδή το τέχνασμα στόχευε μόνο τον κώδικα περιττής πρωτεΐνης, τα κύτταρα έκαναν τη φυσιολογική τους δραστηριότητα, συμπεριλαμβανομένης της παραγωγής σερίνης, αλλά πλέον είχαν πολλά ακόμα φυσικά κωδικόνια. Αφαίρεσαν τους φυσικούς μεταφραστές των κυττάρων, που συνήθως διαβάζουν τα κωδικοποιημένα κύτταρα. Εισήγαγαν νέες συνθετικές εκδόσεις tRNA για να διαβάσουν τα νέα κωδικόνια. Τα τροποποιημένα βακτήρια στη συνέχεια εξελίχθηκαν φυσικά μέσα σε έναν δοκιμαστικό σωλήνα για να αναπτυχθούν πιο γρήγορα.Τα αποτελέσματα ήταν θεαματικά. Το υπερδύναμο στέλεχος, Syn61.Δ3 (ev5), είναι βασικά ένα σούπερ βακτήριο που αναπτύσσεται γρήγορα και είναι ανθεκτικό σε πολλούς διαφορετικούς ιούς, που συνήθως μολύνουν βακτήρια.

Η μελέτη δείχνει τώρα ότι είναι δυνατόν να ξεπεράσουμε το εμπόδιο των μόνο 20 αμινοξέων που αποτελούν τα δομικά στοιχεία της ζωής, αξιοποιώντας τις φυσικές βιολογικές διαδικασίες μας.

ΑΜΠΕ

ΚΟΥΡΗΤΗΣ: ΔΩΣΤΕ ΣΗΜΑΣΙΑ ΣΕ ΔΥΟ ΣΗΜΕΙΑ.
  • "να προσθέσει νέα δομικά στοιχεία σε φυσικά κωδικόνια που είναι πραγματικά «κενά»
  • "στόχευε μόνο τον κώδικα περιττής πρωτεΐνης"
ΤΩΡΑ ΝΟΜΙΖΟΥΝ ΠΩΣ ΕΙΝΑΙ "ΚΕΝΑ" ΚΑΙ ΤΩΡΑ ΝΟΜΙΖΟΥΝ ΠΩΣ ΕΙΝΑΙ "ΠΕΡΙΤΤΗ ΠΡΩΤΕΙΝΗ". ΜΕΤΑ ΑΠΟ ΛΙΓΑ ΕΤΗ ΚΑΙ ΜΕ ΤΙΣ ΠΡΟΟΔΟΥΣ ΤΗΣ ΕΠΙΣΤΗΜΗΣ ΤΟ ΙΔΙΟ ΘΑ ΝΟΜΙΖΟΥΝ; ΕΝ ΤΩ ΜΕΤΑΞΥ ΟΜΩΣ ΘΑ ΕΧΟΥΝ ΔΗΜΙΟΥΡΓΗΣΕΙ ΝΕΟΥΣ ΟΡΓΑΝΙΣΜΟΥΣ ΑΝΘΕΚΤΙΚΟΥΣ ΣΕ ΟΤΙΔΗΠΟΤΕ, ΑΡΑ ΕΝ ΔΥΝΑΜΕΙ ΕΠΙΚΙΝΔΥΝΟΥΣ.

3 comments :

  1. Anonymous12/6/21 02:26

    The fact is that lots of people have received the vaccine — so many that plenty WERE GOING TO DIE OF SOMETHING in the months that followed. By April 23, the end point of the data Carlson cited, more than 135 million people had received at least one dose, more than 40 percent of all Americans.

    https://www.washingtonpost.com/politics/2021/05/06/tucker-carlsons-worst-vaccine-segment-yet/

    ReplyDelete
  2. Anonymous12/6/21 11:57

    "Vaccinated banned from air travel in Russia and Spain due to blood clots"

    http://greeknewsondemand.com/2021/06/12/vaccinated-banned-from-air-travel-in-russia-and-spain-due-to-blood-clots/

    ΜΟΛΙΣ ΠΕΘΑΝΟΥΝ ΜΕΡΙΚΟΙ ΕΜΒΟΛΙΑΣΜΕΝΟΙ ΑΠΟ ΘΡΟΜΒΩΣΕΙΣ ΚΑΤΑ ΤΗΝ ΔΙΑΡΚΕΙΑ ΑΕΡΟΠΟΡΙΚΩΝ ΠΤΗΣΕΩΝ, ΤΟΤΕ ΘΑ ΤΕΛΕΙΩΣΟΥΝ ΚΑΙ ΤΑ ΠΡΟΝΟΜΙΑ ΜΕ ΤΑ ΔΙΑΒΑΤΗΡΙΑ ΚΑΙ ΤΑ ΤΑΞΙΔΙΑ!

    ReplyDelete
    Replies
    1. ΕΧΕΙΣ ΔΙΚΙΟ, ΕΤΣΙ ΕΙΝΑΙ. ΑΚΟΜΗ ΔΕΝ ΕΧΟΥΝ ΑΡΧΙΣΕΙ ΝΑ ΕΜΦΑΝΙΖΟΝΤΑΙ ΟΙ ΠΡΑΓΜΑΤΙΚΕΣ ΠΑΡΕΝΕΡΓΕΙΕΣ. ΑΠΟ ΣΕΠΤΕΜΒΡΗ ΠΟΥ ΘΑ ΕΜΦΑΝΙΣΤΟΥΝ ΚΑΙ ΟΙ ΣΥΝΗΘΕΙΣ ΕΠΟΧΙΑΚΕΣ ΙΩΣΕΙΣ ΘΑ ΑΡΧΙΣΕΙ ΝΑ ΦΑΙΝΕΤΑΙ ΚΑΙ ΤΟ ΠΡΑΓΜΑΤΙΚΟ ΜΕΓΑΛΟ ΠΡΟΒΛΗΜΑ ΤΩΝ ΕΜΒΟΛΙΑΣΜΕΝΩΝ.

      Delete